《高校应用数学学报》创办于1986年，经全国直属高校应用数学学术工作会议决定由浙江大学主办，编辑部设在数学系。首任主编为董光昌教授。现任主编为李大潜和林正炎教授。1993起经国家科委批准增办《高校应用数学学报》B辑，在国内外公开发行。自2007年起，《高校应用数学学报》B辑与全球出版集团Springer加强合作，在海外联合出版发行。AMJCU-B秉着学科交叉、渗透和融合，拓展应用数学研究领域，以及促进有关交叉学科发展的宗旨，重点刊登非数学学科（包括物理、化学、生物、信息、材料、能源、环境、经济、金融等方面）中的应用数学概念、理论和方法方面的研究成果或综合介绍，或介绍数学与其它学科交叉的国际前沿动态、现状及发展趋势等。

　　《高校应用数学学报》是《中国科技论文统计与分析》年度研究报告、中国学术期刊综合评价数据库和中国科学引文数据库的来源期刊。在国外为美国《数学评论》(Mathematical Reviews)、德国《数学文摘》(Zentralblatt für Mathematik/Mathematics Abstracts)、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）等文摘刊物及其数据库的收录与评论。1999年被评为全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊。